Theo đó, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Thanh Hoá yêu cầu UBND TP Thanh Hoá cung cấp các quyết định, tờ trình liên quan đến việc di chuyển chung cư Phan Chu Trinh (trong các năm 2001, 2002, 2007, 2009).
Các quyết định, tờ trình có nội dung như: Phương án di chuyển nhà ở số 1, 2, 3, 4 khu chung cư Phan Chu Trinh; phương án quy hoạch chi tiết phố Phan Chu trinh; phương án hỗ trợ di chuyển các hộ nhà số 1, 2, 3 khu chung cư Phan Chu Trinh và phương án xây dựng nhà chung cư số 2, 3 Mai Xuân Dương (phường Đông Thọ, TP Thanh Hoá); phê duyệt giá trị thanh toán quyết toán công trình hỗ trợ di chuyển nhà số 1, 2, 3, 4 chung cư Phan Chu Trinh, công trình hạ tầng kỹ thuật chung cư mai Xuân Dương…
Theo hồ sơ cho thấy, một phần trong diện tích của khu chung cư Phan Chu Trinh trước đây, sau khi di chuyển, phá dỡ được quy hoạch là diện tích của Dự án Hạc Thành Tower.
Dự án Hạc Thành Tower tọa lạc trên khu đất 'vàng' nằm ở ngã tư đường Hạc Thành và đường Phan Chu Trinh, gần với Quảng trường Lam Sơn, thuộc trung tâm TP Thanh Hoá. Tháng 11/2009, UBND tỉnh có quyết định giao đất cho dự án là 2.706,0 m2, với giá là 21 triệu đồng/m2. Tổng số tiền sử dụng đất mà Công ty TNHH một thành viên Sông Mã (sau này là Công ty cổ phần Sông Mã) phải nộp cho ngân sách Nhà nước là gần 57 tỷ đồng.
Sau 4 năm, cơ quan chức năng tỉnh Thanh Hoá có quyết định phê duyệt tăng tổng diện tích triển khai dự án, nhưng giá đất vẫn giữ nguyên và tiền nộp ngân sách thì lại thấp đi (hơn 48,3 tỷ đồng). Sau khi được bàn giao đất, trong các năm 2014, 2015, 2016, chủ đầu tư là Công ty cổ phần Sông Mã, Công ty TNHH Huy Hoàng (chủ đầu tư cấp II) nhiều lần có các văn bản xin được điều chỉnh công trình, mặt bằng quy hoạch.
Sau khi khởi tố vụ án, khởi tố và bắt tạm giam các bị can để điều tra về tội "Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ" xảy ra tại Dự án Hạc Thành Tower, đến nay phía cơ quan chức năng chưa có công bố thông tin sai phạm liên quan đến dự án này.
Ngày 16/6/2022, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Thanh Hoá có quyết định khởi tố vụ án hình sự “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ” xảy ra tại Dự án đầu tư xây dựng công trình Hạc Thành Tower, địa chỉ số 3 Phan Chu Trinh, phường Điện Biên (TP Thanh Hoá). Quá trình điều tra, CQĐT đã lần lượt khởi tố, bắt tạm giam các bị can: Nguyễn Bá Hùng (SN 1966, Bí thư Huyện uỷ Như Xuân), nguyên Phó Giám đốc Sở Tài chính (thời điểm có hành vi sai phạm) và ông Văn Xuân Hùng (SN 1959), nguyên Trưởng phòng Quản lý công sản giá cả, Sở Tài chính và bà Đinh Cẩm Vân, cựu Giám đốc Sở Tài chính về tội danh nêu trên.